양서류와 파충류는 척추동물의 한 분류군으로 생태계에서 여러 중요한 위치에 있 으나 현재 다양한 원인으로 인해 개체군 감소가 크게 두드러지고 있다. 한편 섬은 육지와 다른 생태지리적 특징으로 인해 이에 대한 연구가 생태학·유전학 등의 학문 분야에 영향을 끼치는 것으로 알려져 있다. 대한민국은 3,300여개의 크고 작은 섬이 있는 반도 국가로 이러한 점으로 인해 섬 생물학 연구에 있어서 적절한 자원을 가지 고 있다고 할 수 있다. 본 연구는 대표적인 섬·연안 생물자원 연구기관인 국립호남 권생물자원관에서 행정구역 내 17개 섬에 서식하는 양서·파충류상을 파악하고자 2021~2022년 동안 실시되었다. 그 결과 인천광역시 6종, 충청남도 13종, 전라북도 3 종, 전라남도 24종, 경상남도 13종, 제주특별자치도 12종 등 총 양서류 14종 및 파충 류 15종의 서식을 확인하였다. 멸종위기종으로는 Ⅱ급인 맹꽁이, 금개구리, 구렁이, 표범장지뱀이 조사되었으며 생태계교란생물로는 안면도부터 전라남도 대부분에서 확 인된 황소개구리와 3개섬에서 확인된 붉은귀거북이 포함되었다. 내륙에서는 보고된 바 있으나 본 연구에서 조사되지 않은 10종도 파악되었다. 추후 지역별 서식하는 종 목록을 꾸준히 최신화하고 확증정보를 확보하여 종의 선호 서식지 유추, 서식지 적 합 요인 도출, 계통분류 및 개체군 유전 다양성 등 섬·연안 생물자원 관련 연구에 기여하고자 한다.